院长的绩效工资在有些地方是由上级部门来确定的，一般按职工平均绩效工资的3倍到4倍设计，最少的也不低于1.5倍。

副院长绩效工资相比院长则相应减少。

而我们在设计院领导绩效工资时，主张将全院科主任平均绩效工资作为基准参考线，院长可设计为科主任平均绩效工资的 1.5-2.0倍，副院长可设计为科主任平均绩效工资1.3-1.8倍，分管医疗的副院长可以比普通副院长提高0.05的系数。