目前大部分公立医院的科室二次分配基本流于大锅饭或院内奖金系数分配的形式，其最主要原因是因为科室主任与护士长的绩效混合在科室绩效中。让科室主任、护士长难以做到公平合理的分配。

因此建议在科室二次分配前，首先应当将科室主任、护士长的绩效从科室剥离，由医院考核后直接发放。

科室主任、护士长的绩效还应该和科室绩效挂钩。科室主任的绩效分为业绩绩效与管理绩效，业绩绩效按科室人均倍数发放，管理绩效按科室绩效总额的百分比发放。以此督促科室主任尽全力将科室做大做强。

而护士长的绩效宜按科室护理人均的倍数发放。从而让科室主任、护士长避免分配的双重身份，在医院二次分配指导方案与结合科室成员的建议下进行公平合理的分配。